Прошло уже два года с того момента, как Мотоко Кусанаги покинула девятый отдел. Её место занял Тогуса, расширивший штат и превративший группу оперативников в более крупную структуру, насчитывающую около двадцати человек. Новая команда сталкивается с чередой загадочных инцидентов, которые выводят их на след выдающегося хакера, известного под прозвищем Кукольник. В ходе расследования Бато сталкивается с Мотоко: уходя, она настоятельно советует держаться подальше от Solid State Society — объединения, призванного поддерживать стабильность государства. Бато пытается понять, не скрывается ли за этими преступлениями сама Мотоко, возможно ли, что она и есть загадочный Кукольник. С каждым новым делом подразделение продвигается к разгадке, но кто же на самом деле скрывается за лицом Кукольника? Как повлияют их отношения на отношения между Бато и Мотоко? И какую правду прячут тщательно запланированные преступления, ведущие к истине?
