После того как Фрактал — система управления миром — взяла на себя управление планетой, человечество достигло долгожданной утопии: Земля стала местом, где трудовая активность не нужна. Все рутинные задачи выполняют аватары, а люди могут заниматься чем угодно по своему выбору. Прошли тысячелетия с момента активации Фрактала; система продолжает работать, однако живых людей, способных понять её принципы, почти не осталось. Обслуживание возложено на служителей Храма, которые больше напоминают культ, чем институт. Подавляющее большинство жителей искренне верят, что сохранность самой системы — единственное условие счастья и безмятежности. Главный герой — молодой парень по имени Клейн, ведущий бесцельную жизнь. Всё меняется, когда он помогает Фрине, беглой жрице Фрактала, спрятаться от неизвестных преследователей. Вскоре Фрина исчезает, оставив Клейну таинственный кулон. Расшифровав содержащиеся в нём данные, он активирует устройство, и оно превращается в девочку-аватара по имени Несса. Так Клейн и Несса отправляются в путешествие: им предстоит найти Фрину, встретиться с участниками группировки «Потерянное тысячелетие» и узнать правду о Фрактале.
