Это обновлённая версия сериала 1972 года, не связанная напрямую с оригиналом и вводящая новых персонажей и автономный сюжет. Ремейк переносит действие в ближнее будущее и расширяет жанр меха за счёт новой линии героев. В грядущие десятилетия человечество делает ещё один гигантский прорыв в энергетике — управлении фотонной энергией, открытие которого сравнимо с великим шагом в ядерной науке. Энергетический источник добывается из руды, найденной у подножия горы Фудзи, и обещает решить мировые проблемы с энергией. Во имя завладения этим ресурсом безумный учёный доктор Хелл вместе со своими приспешниками — бароном Асюра, графом Брокеном и виконт Пигман — формирует армию механических монстров, обнаруженных среди руин античной Греции, и настойчиво стремится проникнуть в лабораторию исследования. Их наступление встречает Ко́дзи Кабуто, дерзкого подростка, управляющего гигантом Мазингер Зет — роботом, созданным на основе фотонной энергии его деда Дзюдзо Кабуто. Но в схватку вмешиваются внешние силы: легендарная цивилизация микенцев и загадочный остров Бардос, а вместе с ними раскрываются таинственные секреты, оставленные самим Мазингером Зет.
