В ближайшем будущем значительная часть суши уже под водой из-за катастрофического повышения уровня мирового океана. Нацуки Икаруга — молодой парень, чьи планы и мечты оказались сорваны тяжёлыми обстоятельствами. Несколько лет назад трагедия неслучайно забрала у него мать и лишила одну ногу. Единственное, что у него осталось, — старый корабль, батискаф и долги, перешедшие по наследству от бабушки, знаменитой профессора морской геологии Нонко Ятигусы. Чтобы расплатиться с долгами, Нацуки отправляется на поиски затонувшего здания, где она когда-то работала, ведь по слухам именно там прячутся её сокровища. Однако вместо богатств он обнаруживает нечто совсем иное — капсулу, в которой дремлет робот-гуманоид по имени Атри. После пробуждения Атри клянётся помогать Нацуки, по крайней мере до тех пор, пока не вспомнится последнее поручение, данное её прежней хозяйкой, и их новая дружба начинает прокладывать путь в суровом мире будущего.
