По истечении семи месяцев после завершения Одногодичной войны остатки Герцогства Зион преобразовались в Республику Зион, но продолжали держать оборону. Дэрил [ダリル・ローレンツ] пилотировал мобильного воина «Психо-Заку» в завершающем этапе конфликта в секторе «Удар молнии», где был разрушен флот Братства Мур. После утраты «Психо-Заку» он направляется на Землю в поисках сведений об Альянсе Южных морей — военной группе, входящей в состав Земной Федерации. Ио [イオ・フレミング], который противостоял Дэрилу, был избран для пилотирования прототипа мобильного воина «Атлас Гандам» и отправлен на Землю.
