Злобный Мегатрон направил на Землю армию Десилицинов, чтобы разграбить планету и выкачать её колоссальные энергетические запасы, подталкивая войну против автоботов. Если им удастся достичь цели, они смогут переломить ход противостояния, уничтожить автоботов и начать грандиозное завоевание Вселенной. В рамках плана десилицины похищают учёного — доктора Юки Ониши, ведущего специалиста Земли в области энергетики и природных ресурсов. Со сыном доктора Ониши, Кодзи, пытается связаться не кто иной, как Оптимус Прайм, который берёт мальчика на спасательную миссию и отправляет его вместе с командой в путь ради возвращения отца. Автоботы действуют смело и мужественно, однако им не удаётся вырвать доктора из плена десилицинов. Теперь на кону — не только судьба Ониши, но и безопасность Земли и её ресурсов: именно автоботы и Кодзи должны преодолеть оборону врага, спасти учёного и остановить Мегатрона и его армию.
