Эта история, разворачивающаяся во вселенной Школьных историй о привидениях, рассказывает о Сацуки Мияношита и её младшем брате Кейтиро, которые возвращаются в родной город матери, чьё пребывание уже на этом свете завершилось. Город встречает их холодной тишиной, и дома, старые школы и знакомые улицы кажутся чужими. В повседневной обстановке начинают происходить необъяснимые вещи: предметы перемещаются сами по себе, слышны шепоты за стенами, а вечерние сумерки оживляют память о прошлом. Сацуки пытается принять наследие матери и находит дневник, который та вела задолго до разлуки. Его страницы становятся ключом к тайнам города, помогающим детям понять, какую роль им предстоит сыграть в этой истории. Множество призрачных историй, происходящих в стенах школы и на школьной территории, переплетаются с семейными секретами, приводя героев к важному выбору и неожиданной дружбе.
