Смотреть Аниме «Крейсер Надэсико: Принц тьмы»

Три года минули с момента окончания конфликта между жителями Юпитера и земной стороной. Акито [天河 明人] и Юрика [御統 ユリカ] считаются погибшими в крушении шаттла, которое случилось через год после войны. Малышка Рури Хосино продолжает службу, но теперь командует Надэсико самостоятельно. Благодаря достижениям в бозонных прыжках началась реализация «Плана Хисаго» — замысла создать широкую сеть порталов, способную связать разрежённые уголки вселенной; если эта сеть окажется в руках недобросовестных сил, последствия будут катастрофическими. Именно поэтому и случается худшее: сеть оказывается захвачена террористами «Наследники Марса» во главе с бывшим юпитерианским офицером, который представляет интересы тех, кто недоволен итогами войны. Чтобы тайно расследовать происходящее, вновь собирается старый состав Надэсико, и на пути к ним появляется неожиданный союзник, готовый ступить в бой ради выяснения правды и спасения всего экипажа.