В аниме Макросс Зеро, выпущенном в 2002 году, рассказывается история пилота истребителя, вовлечённого в войну за объединение человечества после того, как на Землю опустился загадочный чужой космический корабль. Главный герой — Син Кудо — один из пилотов недавно сформированного элитного подразделения Skull, вооружённого новейшими образцами VF-0. Его истребитель терпит крушение на тропическом острове, где жители живут в тесном согласии с природой и местными обычаями. В то же время вокруг разворачиваются ожесточённые сражения, исход которых может определить судьбу всей войны. Над этим регионом сталкиваются мощные боевые машины и загадочные силы, что ставит под сомнение предсказуемость конфликта и держит зрителя в напряжении. По мере развития истории Син понимает, что будущее человечества зависит не только от технической мощи, но и от того, как люди сумеют жить рядом с новой технологией и сохранить человеческие ценности посреди битвы.
